国際常民文化研究機構の基盤となる日本常民文化研究所は、漁業制度資料調査による史資料25万点を含む膨大な資料を所蔵し、長年にわたり庶民の生活文化にかんする調査・研究を行ってきました。また、21世紀COEプログラム「人類文化研究のための非文字資料の体系化」による研究成果が、後継組織で日本常民文化研究所に付置されている非文字資料研究センターに蓄積されています。
本機構における共同研究の目的は、これら日本常民文化研究所と非文字資料研究センターの所蔵する史資料とデータベースを、広く学外の研究者に公開・共有化し、さらに研究分野を拡大、深化させることにあります。そのため第1期事業（2009年度～2013年度）では、５つのプロジェクトを立て、研究課題を公募してきました。第2期事業（2014年度～2019年度）では、共同研究（一般）については、以下の４つのプロジェクトを立て、共同で研究を進めています。
１． 海域・海民史の研究
２． 民具資料の研究
３． 日本常民文化研究所所蔵資料に関する研究
４． 常民文化に関する研究
また、日本常民文化研究所で行われていた、地域の研究者による研究を助成する目的の常民文化奨励研究を2014年度より国際常民文化研究機構が引継ぎ、共同研究（奨励）として毎年公募を実施しています。
※公募は終了しました。
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